Ook woningbouw heeft invloed op stikstof. Tijdens de bouw ontstaat tijdelijke uitstoot door machines en transport. Na oplevering komt structureel stikstof vrij door verkeer en energiegebruik van bewoners. 

Door de huidige staat van de natuur is het vaak moeilijk om vergunningen te verlenen voor woningbouwprojecten, vooral in de buurt van Natura 2000-gebieden. 

Het Rijk en de provincie werken aan maatregelen om dit te verbeteren, zoals emissieloos bouwen en een mogelijk ondergrens voor kleine projecten. Het doel is om in de toekomst weer meer ruimte te creëren voor woningbouw, zonder de natuur verder te belasten.