De natuur is belangrijk voor een gezonde leefomgeving. De provincie voert samen met partners extra maatregelen uit om schade aan de natuur te herstellen. Deze maatregelen zijn noodzakelijk voor de bescherming van verschillende plant- en diersoorten en hun leefgebieden.
Weidevogels leven het liefst op bodems die vol met bodemleven zitten, zoals wormen. De provincie draagt bij aan onderzoek door de organisatie Water Land en Dijken naar verbetering van de bodem. Met behulp van zeeschelpengruis wordt het land verrijkt met belangrijke mineralen, zoals kalk.
Te veel fosfaat in het water is niet goed voor planten en dieren. Een nieuw gemaal gaat ervoor zorgen dat fosfaatrijk water niet meer in de Ankeveense Plassen (Natura 2000 gebied) terecht komt. Zo verbetert daar de waterkwaliteit.
In recreatie- en natuurgebied Het Twiske komen enkele bijzondere vogels voor (bijvoorbeeld de roerdomp) die afhankelijk zijn van moeras en riet. Door de neerslag van stikstof groeit het moeras snel dicht. Met maatregelen wordt het rietveld voor deze vogels hersteld.